海南省现代农业检验检测预警防控中心成立于2012年，2014年6月加挂“海南省农产品质量安全中心”和“海南省绿色食品发展中心”两块牌子，为隶属海南省农业厅的正处级全额拨款事业单位。

中心的主要职责是承担海南省农产品市场准入准出、农产品产地认定和农产品质量安全评价鉴定的检验检测；国家、省农产品质量安全普查、风险评估工作；农产品质量考核检验、产品质量分等分级检验和其他委托检验及认证等工作；“三品一标”（无公害产品、绿色食品、有机食品和农产品地理标志）相关管理和认证工作，对口指导市县、乡镇农产品质量安全和绿色食品管理工作机构开展有关业务。自2015年10月起，中心全面接管海口秀英港、南港和新海港三个码头农产品出岛检查检测站工作，承担出岛瓜菜质量安全检查检测工作。

中心核定财政预算管理事业编制43名，聘用编外人员8名，劳务派遣人员97名，内设办公室、农产品质量安全检测科、农业产地环境监测科、农业投入品检测科、预警预报科、技术设备科、网络信息科等7个科级机构，以及农产品有害物质残留检测实验室、农业环境质量检测实验室、土壤农化检测实验室、肥料质量检测实验室。

中心技术力量雄厚，现有专业技术人员21名，其中博士1名，硕士12名，10人具有高级职称资格，6人具有中级职称资格，是海南省农业厅重要技术支撑部门。中心工作区域面积2560平方米，其中实验室面积960平方米。实验室设计科学、布局合理、设备先进，现拥有三重串联四极杆气质联用仪、超高性能液相串联质普分析仪、气相色谱仪、超高效液相色谱仪、离子色谱仪、氮吹仪、原子吸收分光光度计、电感耦合等离子体光谱、电感耦合等离子体质谱、全自动流动分析仪等190台（套）国际一流的仪器设备，具备开展农产品有害物质残留检测、土壤质量检验、土壤肥料质量检验等工作能力，为确保我省农产品质量安全，促进海南农业产业升级和建设国家热带现代农业基地提供强有力的技术支撑和保障。